A ráncfelvarrás legfeltűnőbb eleme a levegőbelépő-nyílások formájának megváltozása. Eltérés a 2003-ig készülő Yaris és a facelift utáni változat között a lámpa belső-alsó sarkában megjelenő nyúlvány. A visszafogott módosítások minden modellt érintenek a 68 lóerős egyliterestől a Yaris TS sportváltozatig. Kissé átdolgozzák a 998 köbcentis motort is, amelynek csökken a károsanyag-kibocsátása.

A Toyota Yaris volt a Nissan Micrát követően a második japán autó, amely elnyerte Európában az Év Autója díjat. A Micrát az 1993-as, a Yarist a 2000-es évre választották az Év Autójává.